Исекешев в разные годы работал помощником президента, министром индустрии и торговли РК, заместителем премьер-министра-министром индустрии и новых технологий, министром индустрии и новых технологий, а позже заместителем премьер-министра по совместительству.

С августа 2014 года возглавлял министерство по инвестициям и развитию РК.